A cégkapus regisztrációt az okmányiroda, valamint a személyi adat- és lakcímnyilvántartó végzi, ez a kormányzati portálról letölthető űrlap révén elektronikusan, vagy kinyomtatott változatával személyesen teljesíthető. Míg a magánszemélyek első ügyfélkapuja ingyenes (továbbiakért fizetni kell), a vállalkozásokat tervek szerint már első cégkapujuk fejében is díjfizetésre köteleznék.

A regisztrációt az ügyfélkapuval rendelkező, a cég képviseletére feljogosított személy végezheti. Elektronikus regisztációhoz saját ügyfélkapu szükséges. Ilyenkor a központi rendszer a személyi adat- és lakcímnyilvántartásban ellenőrzi, elégséges-e a képviselő egyértelmű azonosítására cégnyilvántartásban is rögzített, viselt neve és anyja születési neve. Ha a vizsgálat negatív eredménnyel zárulna, akkor a regisztráció csak személyes megjelenéssel végezhető el. Ezután a cégnyilvántartásban azt is ellenőrzik, hogy az érintett személy önállóan jogosult-e a cég képviseletére. Ha a két feltétel együttesen teljesült, és díj vagy az arra vonatkozó, visszavonhatatlan fizetési ígéret megérkezett, a regisztrációt kérő saját ügyfélkapujára kapja meg a cégkapu azonosítóját és az egyszer használatos jelszót. A regisztrációs felület kezelésére a jelszócserét követően adnak jogosultságot. Együttes cégjegyzés esetén, meghatalmazás alapján történő cégkapu létesítésre csak az azt igazoló dokumentumok bemutatásával, személyesen lesz lehetőség.